母方の伯父である越後国の戦国大名・上杉景勝の養子となり、天正11年（1583年）に上杉義真と名乗った（継嗣扱い）。しばらくして、上杉家を出て河内国に住していた実父・義春の許で暮らす。義真は畠山姓に復し、名実共に能登畠山氏の名跡を継承した。<br>
慶長6年（1601年）、徳川家康に拝謁して近侍を務める。元和3年（1617年）には大和国宇智郡に3120石の知行を与えられ上級旗本となった。