後土御門天皇は、応仁の乱の最中に即位し、朝廷の衰退を目の当たりにした。戦乱で財源が枯渇し、儀式も中断されたが、彼は朝儀の復興に尽力。避難生活中には、足利義政の室町第で過ごし、義政や日野富子と関わりを持った。疫病流行時には般若心経を取り寄せ、祈祷を命じた。即位中に5度の譲位を試みたが、足利将軍家に拒否され、崩御後も葬儀が遅れるなど困難な状況が続いた。仏教に帰依し、貧窮を自身の罪と認識し、阿弥陀仏に救いを求めた。