平宝字8年（764年）に発生した藤原仲麻呂の乱では、近江国へ逃走した仲麻呂軍を孝謙上皇軍が追討した際に、蔵下麻呂は討賊将軍として将兵を率いて援軍として参じる。ちょうど近江国高島郡三尾崎で両軍が膠着状態にあった際、蔵下麻呂の加勢によって状況は急激に上皇側に傾き、間もなく仲麻呂軍は全滅した。